Die bekanntesten Holzkrankheiten sind : Esca, Eutypiose und BDA (Black Dead Arm). Bei der Führung der Weinstöcke sind mehrere Vorsichtsmaßnahmen zu treffen: Art und Zeitpunkt des Beschneidens, die Kontrolle der Düngung oder der Wasserzufuhr. Je nach Befall müssen die betroffenen Rebstöcke gerodet oder vernichtet werden.

Die Symptome für Esca zum Beispiel zeigen sich ab Juli auf den Blättern. Bei den Grundblättern und später am gesamten Zweig sind Verfärbungen zwischen den Blattrippen zu beobachten. Dann folgt das schnelle Austrocknen des Fußes (einige Stunden oder Tage) oder Apoplexie. Im Holz sind stellenweise oder zentral Nekrosen mit hellen und weichen Bereichen zu erkennen, die von braunen Bereichen umgeben sind.

Diese Krankheiten treten überall in Europa auf. In Frankreich betrifft dies 40% der Weinberge mit 10-15% befallener Stöcke.

Die Ansteckung erfolgt durch Verletzungen beim Beschneiden der Reben, die den Pilzen eine Eintrittspforte in den Rebstock bieten, insbesondere in milden und regenreichen Wintern. Die Zeitspanne zwischen Beschneidung und Ansteckung ist zeitabhängig. Die Biologie und Epidemiologie dieser Krankheiten sind jedoch noch weitgehend unbekannt.

Zuletzt bestätigte eine Studie, dass mechanisches Beschneiden die Esca-Probleme deutlich verringert und gleichzeitig die Arbeitskosten senkt. Man spricht von 2 bis 3 Mal weniger Symptomen im Vergleich zum manuellen Beschneiden mit dem Cordon de Royat: So lautet die Feststellung der Landwirtschaftskammer des Departements Gard. Andere Experimente berichten von einem Rückgang der Sterblichkeit um 61 %.

Eine mögliche Erklärung ist, dass beim mechanischen Beschneiden nur das diesjährige Holz geschnitten wird, wobei beim Durchfahren der Maschinen kaum Wunden an älterem Holz entstehen. Es gibt mehr, aber kleinere, besser unterteilte Trockenzonen, sodass die Pflanze besser damit umgehen kann.

Dennoch entstehen beim mechanischen Beschneiden zu viele Pflanzenreste, die in die Weinlese gelangen und einen unerwünschten Geschmack verursachen können. In Frankreich ist dies durch die AOC nicht erlaubt! IGPs oder Vin de France akzeptieren sie hingegen.